1955年大学毕业之际，邱蔚六前往上海第二医学院广慈医院（现瑞金医院）报到。当时，经1952年全国院系大调整，上海第二医学院由三校合并而成，1953年建立了新中国第二个口腔颌面外科病房（第一个病房1951年诞生在华西），急需人才。邱蔚六就这样来到了上海，见证、参与、推动着中国口腔颌面医学的发展壮大。

慕名前来看他的病人太多，找他加号成了家常便饭，学生们一度担心他的身体，想劝退病人。但他总是说，来找他看病的多是些外地的疑难病人，来上海一趟不容易。面对形形色色病情不同、性格不同的病人，甚至是面对病人的唠叨，邱蔚六总是仔细听完病人的陈述，进行全面而有的放矢的检查，很快做出判断，制定诊治方案。

2001年，邱蔚六当选中国工程院院士，成为口腔医学界首位院士。尽管如此高的医学成就，几十年来，邱蔚六坚持只出普通专家门诊，不出特需门诊。

八重神子神秘大欧派奖励5月24日22时50分，上海交通大学医学院附属第九人民医院发布讣告：中国共产党优秀党员，卓越的医学家、教育家、科学家，中国口腔颌面外科、头颈肿瘤外科以及口腔颌面修复重建外科的创建者和开拓者之一，中国工程院院士，中国医学科学院学部委员，国家口腔医学中心、国家口腔疾病临床医学研究中心名誉主任，中华口腔医学会名誉会长，国际口腔颌面外科医师协会理事，全国先进教师，全国卫生系统先进工作者，上海市教育功臣，上海交通大学荣誉讲席教授，上海交通大学医学院附属第九人民医院原院长，上海交通大学口腔医学院原院长邱蔚六同志，因病医治无效，于2024年5月24日16时08分在上海逝世，享年92岁。

1965年，因学科调整，邱蔚六与老师们服从分配，由广慈医院调至上海第九人民医院工作。邱蔚六专注于学习，每天查文献，搞解剖研究，每天工作时间长达10小时以上，他在口腔外科领域推出了诸多的“首创”技术，如在国内率先开展颅颌面联合切除术治疗晚期口腔颌面部恶性肿瘤；首次提出全额隧道皮瓣一次转移立即修复口腔癌术后缺损获得成功；上世纪70年代末，他率先将显微外科技术应用于口腔颌面外科整复畸形与缺损；他还倡导口腔癌的综合序列治疗，使生存率与生存质量都获得明显进步。

公开资料显示，邱蔚六，1932年出生，他是我国口腔医学界第一个中国工程院院士。从事医学教研工作60多年，他擅长颌面部肿瘤与整复外科，为“中国式口腔颌面外科”创造了诸多“第一”，挽救的患者难以计数。

入职广慈医院10年中，邱蔚六师从张锡泽教授、张涤生教授两位恩师。其中，张涤生是我国整形修复外科名家、中国工程院院士，被誉为“中国整外之父”。在两位恩师带领下，邱蔚六奋力在口腔颌面外科这个新生学科里开垦，日夜拼搏。

在邱蔚六的精心培养下，一大批优秀的口腔医学人才脱颖而出，包括中国工程院院士、教育部新世纪百千万人才、卫生部有突出贡献中青年专家以及多名口腔医学院校领军人才等，为我国口腔医学界培育出一片“人才森林”。

邱蔚六还常对学生说：要做一名学者型的外科医生，不要成为一名只会开刀的工匠。要善于寻根刨底，知其然，更知其所以然；要不断地学习、更新知识；要会做、会写、会沟通。谆谆善诱，因材施教，邱蔚六带教学生，会根据学生的个性特征，为每个人规划一条更适合他们走的事业道路。

邱蔚六曾获国家发明奖、科技进步奖3项，还曾获部市级科技进步奖和何梁何利科学与技术进步奖20余次。他主编专著 10 余部，协编 20 余部，在国内外杂志上发表论文 400 多篇。

因为他的工作，世界口腔颌面医学界认识了“上海九院”。2009年，国际口腔颌面外科医师学会将其最高奖项“杰出会士奖”授予时年77岁的邱蔚六。此前，全球只有5人获得过这一目前世界口腔颌面外科领域的最高荣誉奖项，在亚洲，邱蔚六是第一人。