《程序规定》确立了海警机构办理涉外行政案件的基本原则，规定了有关强制措施的适用条件和实施程序，明确了行政执法全过程记录、执法办案信息化等要求。

《程序规定》明确了海警机构开展现场监督检查的范围、方法和措施，确立了调查取证的原则和要求，规范了询问、勘验(查)、检查、鉴定、辨认、查询、抽样取证等调查措施和行政强制措施的实施程序，完善了听证程序、简易程序、行政案件快速办理的相关规定，明确了违法行为追究时效和案件办理期限，规定了海上治安调解的适用范围和调解原则，明确了涉案财物保管、处置要求，规范了罚款和行政拘留执行等内容。

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《程序规定》明确了海警机构开展海上行政执法工作的基本原则，确立了海上行政案件管辖原则和管辖争议的解决方法，规定了回避的适用条件、程序及救济措施。