连翘的副作用：
1、常见消化道反应，表现为恶心、呕吐、腹痛或腹泻等。
2、肝肾损害，在治疗过程中可发生轻度一过性血清氨基转移酶升高，偶尔可出现肝毒性症状，尤其易发生于有严重基础疾病（如艾滋病和癌症）的患者；某些患者，尤其有严重基础疾病（如艾滋病和癌症）的患者，可能出现肾功能异常。
3、过敏反应，对于此药有过敏体质的患者可出现皮疹的症状，偶可发生严重的剥脱性皮炎（常伴随肝功能损害）、渗出性多形红斑。
4、偶尔可发生周围血象一过性中性粒细胞减少和血小板减少等血液学检查指标改变，尤其易发生于有严重基础疾病（如艾滋病和癌症）的患者。
连翘败毒丸副作用，也就是不良反应，除了以上所介绍的外，还可出现头晕、头痛等症。当然，这些不良反应都不是普遍的现象，所以大家不要特别的紧张。
连翘的食用禁忌：
脾胃虚弱，气虚发热，痈疽已溃、脓稀色淡者忌服。
①《本草经疏》：痈疽巳溃勿服，大热由于虚者勿服，脾胃薄弱易于作泄者勿服。
②《本草通玄》：久服有寒中之患。