龙胆草的副作用：
（一）传统文献
《本草纲目》：无毒。“但大苦大寒，过服恐伤胃中生发之气，反助火邪，亦久服黄连反从火化之义。”
（二）毒理试验
LD50：龙胆碱小鼠灌服LD50为460mg／kg，也有报道龙胆碱小鼠灌服LD50为1300mg／kg。
（三）临床观察
无毒。在常规剂量内水煎服对湿热病人没有不适反应。对无湿热之症病人常规剂量内水煎服即有食欲减退、恶心、多尿等副作用。饭后服用或用量过大，可使消化功能减退，并会出现头痛、头晕、颜面潮红等副作用。
（四）少用则健，多用则伤
龙胆草大苦大寒，比黄芩、黄连更苦，能清泄肝胆湿热，少用健胃，多用伤胃；少用保肝，多用伤肝。舌苔黄腻El苦口臭者服龙胆草不辨其苦，食欲能增。如湿热已清，舌苔已化，再服龙胆草，则其苦难受，上则恶心，下则多尿。
中医传统认为龙胆草是纯阴之药，多用能明损脾胃后天之火，暗耗肝肾先天之火。
龙胆草健胃是有条件的，是针对脾胃肝胆湿热积滞之实证，不是针对脾胃虚弱而食欲不振。用错了能使人恶心、呕吐，食欲更加减退。对于湿热积滞之开胃，宜空腹少量服用。
(五)龙胆草用治湿热为宜，剂量偏小为宜本药用治于湿热证为宜，并以湿热清化为度，有效辄止，不宜多服久服。在使用前应询问和看一下有否口苦和舌苔黄腻，有的才是湿热的表现，如没有这些表现，宜谨慎使用本药。常用剂量3——9g，最大不宜超过9——12g，剂量偏小为宜。本品使用不当出现副作用的情况临床时有发生的。
龙胆草的食用禁忌：
【注意事项】：
脾胃虚弱作泄及无湿热实火者忌服，勿空腹服用。本方药物多为苦寒之性，内服每易有伤脾胃，故对脾胃虚寒和阴虚阳亢之证，或多服、久服皆非所宜。