板蓝根的副作用：
1、幼儿过多服用苦寒的板蓝根，会致胃气受损。小孩服用板蓝根时，也不可用成人剂量，更不要长期大剂量服用。
2、健康人服用板蓝根过多会伤及脾胃。长期内服可致食欲减退、体瘦、神疲少动、吐清涎、腹泻、腹痛、腹胀等。
3、有的人为了预防感冒把板蓝根冲剂当茶喝，或者患感冒就用板蓝根治疗，其实板蓝根不能防治所有感冒，尤其不适用于风寒型感冒、阴虚感冒。
4、体质虚寒者，平素就怕冷、脾胃不和且易腹泻者，更不宜用板蓝根冲剂预防感冒，否则会导致畏寒、胃痛、食欲不振等症状。
5、板蓝根还可致皮肤过敏反应及消化、造血系统不良反应，板蓝根注射液引起的过敏反应主要为头昏眼花、胸闷、气短、呕吐、面唇青紫、结膜充血、两眼胀痛、心慌、烦躁、四肢麻木、全身皮肤潮红、瘙痒、皮疹或荨麻疹，严重时可引起过敏性休克，甚至危及生命。
毒性：靛玉红的急性毒性试验：小鼠腹腔注射的LD50为1.1-2.0g／kg。小鼠灌胃5g／kg，连续5天，观察1周，结果未见动物发生死亡和出现明显毒性反应。亚急性毒性试验：以犬分别灌胃靛玉红20、100、200mg／kg连续6mo，结果小剂量组的食欲和生长情况与对照组相似，而大、中剂量组服药后动物出现食欲减少、腹泻、便血以及SCPT升高和灶性肝细胞坏死等反应。但3个剂量组的血象、骨髓象都未见明显抑制，对肾功能、心电图也无影响。
板蓝根的食用禁忌：
注意事项：
体虚而无实火热毒者忌服。
中药板蓝根虽有抗病毒的作用，但中医学把感冒分为风寒型感冒和风热型感冒两大类，又由于季节的不同，感受外邪（致病因 子）的不同，又有夹湿、夹暑、夹燥的不同，如果患感冒不分寒热、虚实和夹杂，一味用板蓝根治疗，是不科学的。