青蒿的副作用：
在常规剂量内水煎服没有不适反应。长期服用或大剂量(30g以下)水前服也没有明显副作用。
临床应用青蒿浸膏片治疗疟疾590例，仅3.4%的患者出现恶心、呕吐、腹痛和腹泻等消化道症状。用青蒿素各种制剂治疗患者2089例，均未见明显副作用。动物实验及人体试服观察表明：青蒿中提得的抗疟有效部分及其有效单体青蒿素对动物及人体主要脏器均无明显影响。水混悬剂肌肉注射时局部可有轻微疼痛，亦有报道，使用青蒿素注射液引起过敏反应。
青蒿的禁忌：
①《本草经疏》记录：产后血虚，内寒作泻，及饮食停滞泄泻者，勿用。凡产后脾胃薄弱，忌与当归、地黄同用。
②《本草通玄》记录：胃虚者，不敢投也。